Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Foxe3Q9QY14 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Foxe3Q9QY14 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Foxe3Q9QY14 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Foxe3Q9QY14 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Foxe3Q9QY14 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Foxe3Q9QY14 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Foxe3Q9QY14 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Foxe3Q9QY14 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Foxe3Q9QY14 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Foxe3Q9QY14 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms