Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpsf3Q9QXK7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms