Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sall2Q9QX96 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sall2Q9QX96 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms