Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc5Q9QX29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms