Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rai2Q9QVY8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rai2Q9QVY8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms