Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc2lQ9JME7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc2lQ9JME7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms