Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3b2Q9JME5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3b2Q9JME5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms