Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Hmgn5Q9JL35 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Hmgn5Q9JL35 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hmgn5Q9JL35 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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