Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Chrac1Q9JKP8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Chrac1Q9JKP8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms