Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msgn1Q9JK54 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msgn1Q9JK54 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms