Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra4Q9JJT2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms