Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scube2Q9JJS0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms