Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Riox1Q9JJF3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Riox1Q9JJF3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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