Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkc1Q9ESX5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms