Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Pgpep1Q9ESW8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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