Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rb1cc1Q9ESK9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms