Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn3Q9ES97 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms