Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn12Q9ER56 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn12Q9ER56 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms