Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r41Q9EQ44 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms