Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufa8Q9DCJ5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndufa8Q9DCJ5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms