Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpne8Q9DC53 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms