Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Csnk1dQ9DC28 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms