Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Riok3Q9DBU3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms