Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc97Q9DBT3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms