Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cnpy3Q9DAU1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms