Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sgf29Q9DA08 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms