Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc103Q9D9P2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc103Q9D9P2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms