Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmco5aQ9D9D5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmco5aQ9D9D5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms