Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D979 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D979 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D979 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D979 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D979 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms