Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slx4ipQ9D7Y9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slx4ipQ9D7Y9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms