Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Echdc3Q9D7J9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Echdc3Q9D7J9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms