Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp4cQ9D7F7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Chmp4cQ9D7F7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms