Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nop56Q9D6Z1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nop56Q9D6Z1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nop56Q9D6Z1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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