Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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