Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc94Q9D6J3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc94Q9D6J3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms