Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sf3a3Q9D554 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms