Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc105Q9D4K7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc105Q9D4K7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms