Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efhd1Q9D4J1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms