Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lonrf3Q9D4H7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms