Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sgms2Q9D4B1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms