Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syce1Q9D495 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syce1Q9D495 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms