Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cfap53Q9D439 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cfap53Q9D439 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms