Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx29Q9D3S3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Snx29Q9D3S3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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