Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rufy3Q9D394 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rufy3Q9D394 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms