Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pramef12Q9D2F1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms