Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syf2Q9D198 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syf2Q9D198 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms