Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Susd3Q9D176 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Susd3Q9D176 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms