Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc47Q9D024 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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