Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx7Q9CY18 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms