Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sgo1Q9CXH7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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